2022年11月13日 星期日

新科技挑選合適「代理孕牛」產下特定遺傳特徵乳牛

丹麥技術大學(DTU)研究人員使用AI技術、生物資訊學和DNA定序,改善乳牛胚胎移植育種計畫,他們研究指出,這可以使世界各地乳牛更強壯與健康,而他們研發挑選代理孕牛的技術,可能改變全球育種方式 。





透過移植受精卵育種,可以結合特定公牛、母牛的遺傳特徵到「代理孕母」中,幫助農民更容易預測生產結果。


就另一方面而言,更優異的胚胎冷凍保存方法,如:快速冷凍與更好的掌控溫度,意味我們可以在世界各地任何地方,獲得所需的DNA,不需再運輸活體動物,「胚胎移植技術」使每人都能擁有良好基因的畜牧動物,也避免動物在運輸中受驚嚇、痛苦或受傷。


出於此原因,「胚胎移植技術」在其他領域也相當受歡迎,例如:馬,然而這是相對昂貴的育種方式,因此成功率對整體育種計劃的價值、普及率至關重要。


尤其在開發中國家,此技術對國家糧食安全、福祉與消除貧困具顯著影響,但通常開發中國家的農民無法負擔多次徒勞無功的嘗試,因此如何選擇合適的「代理孕牛」相當關鍵,目前為止,我們常從身體、特徵的觀察著手,但仍有些不確定因素可能是肉眼看不出來的。


對此,博士後研究員瑪麗亞·貝倫·拉巴格利諾(Maria Belen Rabaglino),以及教授哈賈.卡達米丁(Haja Kadarmideen)已經確定一種能消除不確定性,並可能改變全球育種方式。



子宮內膜與AI智慧

激素以及多種因素都會影響懷孕難易程度,因會間接影響身體細胞工作模式,不過,這適用於直接跟受精卵互相作用下的子宮內膜,也就是說,子宮內膜的細胞活動,在高懷孕機率及無懷孕機率的動物間不同。


不過這中間細胞究竟是怎麼變化?變化指出什麼訊息?哪些變化能告訴我們育種計畫已經開展了?帶著這些疑問,瑪麗和哈賈決定對此展開研究,期望開發出一種全新、更安全的方法識別最佳代理孕母。


起初,他們想透過卵子移植確定子宮內膜變異,因此尋找基因表現型的模式。瑪麗亞分享,他們使用先進技術集成的數據、生物信息,準備52頭乳牛的大量基因表現數據,並使用於機器學習(ML,人工智慧的一種),這相當適合在複雜數據中尋找模式。


接著,他們使用兩種類型的機器學習算法,並對結果交叉比對,辨識出內膜基因表現型的模式,且此模式達到至少90%準確率,成功完成胚胎移植。


也透過此方式,該項目的人工智慧頭腦出現一種模式,演算法推估出的生物標記,幾乎與所有成功懷孕的「代理孕母」情況相似,有了此技術,可以幫助胚胎移植育種計畫成功率大幅增長,且誤差小於5%。


哈賈分享,他們的的研究,使選擇合適「代理孕母」成為可能,而且比現有方法更準確,雖然乳牛跟人類有很大不同,但他們認為未來這50個生物標記,或許未來能應用在人類身上,幫助人工受孕。


參考資料/DTU

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